디지털 육종의 선두주자

생물정보 분석 전문 기업 씨더스 & 분자마커 개발 전문 기업 지노타입

씨더스와 지노타입은 고객분들이 연구과제 프로젝트 진행 과정 중 필요한 초기단계의 디지털 육종 연구설계, 생물정보 생산에서 생물정보분석과 분자마커 개발 및 이를 활용하는 영역까지, 다양한 기술 개발 및 다년간의 분석경험을 축적하였습니다. 이를 기반으로 유전체 데이터를 활용한 다양한 목적의 생물정보 분석과정에서 효율성을 최대로 증진시키는 다양한 기술 서비스를 제공하여 여러분의 연구를 지원합니다.   ​

(1) 디지털 육종을 위한 GBS 활용 교배집단 또는 유전자원의 유전적 다양성 분석

다양한 생물의 GBS library 제작 및 생물정보 분석의 풍부한 경험 축적

수목, 어류, 조류, 곤충, 작물 등의 다양한 유전자원에서 자원 내 집단 별 대립 유전자 수, 이형 접합도(기대치, 관찰치)를 통한 유전다양성, pairwise F 통계값과 AMOVA 분석결과를 통한 유전분화 및 Structure, PCA, DAPC 등을 통한 유전구조 분석

다양한 작물의 교배집단 기반의 유전지도 작성과  QTL mapping 및 이를 이용한 형질연관 마커 개발로 적용가능한 결과 도출 

*GBS ; Genotyping-by-sequencing​

(2) RNAseq 기반 유전자 예측 및 유전자 발현 분석을 통한 유용 유전자군 탐색

특정조건에 따라 다양하게 반응하는 유전자들을 유전자 풀(database)에서 확인

다양한 metabolic pathway 에 따라 유전자 발현 패턴(profiling) 분석 실시

특정 물질 생합성 관련 유전자, 열매 성숙 시기 조절 유전자, 전사조절인자(TF) 등 다양한  형질 관련 유전자 분석

Lnc(Long-non-coding) RNA prediction

(3) 디지털 육종을 위한 웹 데이터베이스 개발

다양한 Omics 데이터들의 분석 결과를 통합하여 작물 유전체 정보 해석을 지원하는 Integrated Omics DB 구현

국가 농생명 데이터 정보 시스템 구축

작물별 육종지원용 Web Database 구현

유전체 분석 결과 가시화 툴(viewer) 개발

(4) 디지털 육종 지원용 분자마커 개발 및 검증

토마토(2013, Nature), 고추(2014, Nature Genetics) 표준 유전체 염기서열 해독 공동 연구 참여

세계 최초 탄저병 저항성 바이오마커 개발 성공 및 고추 신품종 개발((주)고추와육종, 농촌진흥청 협력)

국내 최다 주요 채소(토마토, 고추, 배추 등), 과수(사과, 배 등), 주곡작물(벼, 콩 등)의 유전체 서열 및 SNP 분자마커 확보​