식물과 육종을 아는 생물정보분석 전문 기업 씨더스 

SEEDERS의 생물 정보 분석 서비스 

씨더스는 고객분들이 연구과제 프로젝트 진행 과정 중 요구되는 초기단계의 연구설계, 생물정보 생산에서 생물정보분석과 분자마커 개발 및 이를 활용하는 영역까지, 다양한 기술 개발 및 다년간의 분석경험을 축적하였습니다. 이를 기반으로 생물유전체 데이터를 활용한 다양한 목적의 생물정보 분석과정에서 효율성을 최대로 증진시키는 다양한 기술 서비스를 제공하여 여러분의 연구를 지원합니다.  

GBS (Genotyping-by-sequencing) 기반 교배집단 또는 유전자원의 유전적 다양성 분석

°  다양한 생물의 GBS library 제작 및 생물정보 분석의 풍부한 경험 축적 

°  수목, 어류, 조류, 곤충, 작물 등의 다양한 유전자원에서 자원 내 집단 별 대립 유전자 수, 이형 접합도(기대치, 관찰치)를 통한 유전다양성, pairwiseF 통계값과 AMO      VA 분석결과를 통한 유전분화 및 Structure, PCA, DAPC 등을 통한 유전구조 분석 

°  다양한 작물의 교배집단 기반의 유전지도 작성과 QTL mapping 및 이를 이용한 형질 연관 마커 개발로 적용가능한 결과 도출

RNAseq 기반 유전자 예측 및 유전자 발현 분석을 통한 유용 유전자군 탐색

°  다양한 생물의 특정 조건에 따라 다양하게 반응하는 유전자들을 전체 유전자 풀을 기반으로 확인하고 생물내 다양한 metabolite 경로에 따라 발현 프로파일링 분석 

°  특정 물질 생합성 관련 유전자, 열매 성숙시기 조절 유전자, 전사조절인자(TF)등 다양한 형질 관련유전자 분석 

°  Lnc (Long-non-coding) RNA prediction 

고객 맞춤형 웹 데이터베이스 개발

°  다양한 Omics 데이터들의 분석 결과를 통합하여 작물 유전체 정보 해석을 지원하는 Integrated Omics DB 구현 

°  국가 농생명 데이터 정보 시스템 구축 

°  작물별 육종지원용 Web Database 구현 

°  유전체 분석 결과 가시화 툴 (viewer) 개발 

육종 지원용 분자마커 개발 및 검증

°  토마토 (2013, Nature), 고추 (2014, Nature Genetics) 표준 유전체 염기서열 해독 공동 연구 참여 

°  세계 최초 탄저병 저항성 바이오마커 개발 성공 및 고추 신품종 개발 ((주)고추와 육종, 농총진흥청 협력) 

°  국내 최다 주요 채소 작물 (토마토, 고추, 배추 등), 고수작물 (사과, 배 등), 주곡작물 (벼, 콩 등)의 유전체 서열 및 SNP 분자마커 확보 ​