표준유전체 정보가 밝혀지고 NGS(Next Generation Sequencing)를 이용한 대용량 시퀀스 생산이 가속화되면서 유전체 기반의 분자육종은 종자시장 및 육종산업에 새로운 동력으로 각광받고 있습니다. 분자육종은 원하는 형질의 유무를, 형질에서 유래한 표현형의 관찰 없이 DNA 염기서열의 차이를 보이는 분자마커(molecular marker)를 이용해 판별하는 기법입니다.
따라서 실질적으로 육종 소재에 적용 가능한 마커, 형질 관련 마커 등 분자마커 set 개발이 매우 중요합니다. 최근에는 이를 이용한 정밀육종(precision breeding)이 시도되고 있습니다.
​
가장 대표적인 분자마커 중의 하나인 SNP(Single Nucleotide Polymorphisms)는 DNA 서열에서 일어나는 단일 염기의 변이로 유전체 전체적으로 가장 빈번하게 나타나며, 안정적으로 이용할 수 있는 장점이 있습니다. 이에 따라, 최근 여러 작물에서 NGS를 통해 해독된 유전체 정보를 기반으로 한 genome-wide SNP 발굴로 대량의 분자마커를 빠르게 확보하고 있습니다.
또한 SNP는 in silico 분석을 통해 농업적으로 중요한 유전자를 확인할 수 있는 유용한 MAB 마커로 사용되는 등 응용 범위가 확대되고 있습니다.
 
 
SNP 분자마커 개발 전략은 아래 그림과 같습니다.

 

Resequencing된 개체를 reference genome과 염기서열 비교를 통해 genome-wide SNP를 발굴합니다.
목적형질 관련 유전자에서 개체 간의 SNP를 비교하고, 개체 간의 차이를 보이는 SNP를 분자마커로 개발하고 있습니다.
저희 씨더스는 수백 개체의 교배집단 및 유전자원들을 resequencing하고, genome-wide SNP를 발굴하는 과정을 거치면서 씨더스만의 노하우를 축적하고있으며, 고객 중심의 결과를 드리기위해 꾸준히 분석하고 개발하고 있습니다.
 
SNP 분자마커는 다음과 같은 응용분야에 이용될 수 있습니다.
- 특정 품종 구분용 마커
- 중요형질 및 목적형질 식별 마커
- MAS(Marker-Assisted Selection)
- MAB(Marker-Assisted Backcrossing)

+++
식물분야에서 전문화/차별화된 분석 및 고객 서비스로 다가가는 씨더스가 되도록 최선을 다해 노력하고 있습니다.
전화, e-mail, 홈페이지 문의 등 언제든지 열려있습니다.
궁금하신 사항이 있으시면 언제든지 연락주세요:-)
(상담, 컨설팅 가능)

(기업 대표전화) 042-710-4035