씨더스와 함께 GBS 분석을 시작하세요!

GBS 씨더스와 함께 GBS 분석을 시작하세요!

Date 2016-03-02

“씨더스와 함께 GBS 분석을 시작하세요!”
(Genotyping-By Sequencing)

GBS library construction workflow

GBS library quality가 매우 중요!

“씨더스와 함께하면 가능합니다!”
GBS 응용 (교배집단의 형질 연관 지도 작성)

GenomeCoverage 확보

벼 집단의 GBS 분석을 통해 게놈 전체에서 균형 있게 시퀀싱 결과(reads)를 확보할 수 있음을 확인했습니다.

Chromosome 별 SNP 분포

GBS 시퀀싱 및 분석을 통해 염색체 전체에서 고르게 분포하는 SNP마커를 확보 할 수 있습니다.

품종 공통/특이적 SNP 확보

품종 간 공통적인 SNP와 특이적인 SNP를 분석한 그래프 입니다. 이 결과로 원하는 품종 또는 조합별 공통/특이 SNP 마커를 선발하여 MAB에 적용할 수 있습니다.

•GBS 분석 프로그램(TASSEL) 대비 9배 이상의 Raw data 사용이 가능합니다.
•유전체 전체 부위를 균형 있게 약 10만에서 20만 포인트 부위의 시퀀싱 정보를 얻을 수 있습니다.
•대표적인 분자마커인 Single Nucleotide Polymorphisms(SNP)를 대량으로 확보할 수 있습니다.
•품종별 마커, 원산지 구별 마커 등 목적에 맞는 SNP marker를 개발할 수 있습니다.

씨더스와 함께 하면!

DNA quality required for GBS
•농도 : 50-100ng/㎕, total vol.: 30-50 ㎕
•Column kit를 이용하여 protein 혹은 RNA에 오염되지 않게 gDNA 분리
•분리된 gDNA 는 Agarose gel running 후, 샘플 별 gDNA 농도를 최대한 비슷하게 맞추어 주세요. Gel 사진을 함께 주면 좋아요

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