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나도 해보자, 바이오 인포메틱스! NGS 분석 소프트웨어 SPADE
SEEDERS의 기술적 노하우를 접목한 다양한 분석 프로그램을 탑재한 소프트웨어를 개발하였습니다! 리눅스 서버 뿐만 아니라 Cloud 서버 시스템과의 연동이 가능해 저렴한 비용으로 연구자분께서 직접 분석을 할 수 있는 소프트웨어 입니다. 씨더스의 기술적 노하우를 접목한 4가지 분석 파이프라인에 분석과정의 단순화, 독립화, 시각화를 시도하였습니다.…
2014-06-23
Genome
정밀육종을 위한 SNP Molecular Marker 개발
표준유전체 정보가 밝혀지고 NGS(Next Generation Sequencing)를 이용한 대용량 시퀀스 생산이 가속화되면서 유전체 기반의 분자육종은 종자시장 및 육종산업에 새로운 동력으로 각광받고 있습니다. 분자육종은 원하는 형질의 유무를, 형질에서 유래한 표현형의 관찰 없이 DNA 염기서열의 차이를 보이는 분자마커(molecular marker)를 이용해…
2014-05-19
RNAseq
공동연구를 통한 양배추 RNA-SEQ을 이용한 유전자 서열 조립 논문 발표 (PLoS ONE저널에…
씨더스의 전사체 분석팀은 한국생명공학연구원의 권석윤 박사님 실험실과 공동연구를 통해 양배추(Brassica oleracea var. capitata L.)의 transcriptome de novo assembly를 통한 유전자서열조립을 주제로 PLoS ONE 저널에 2014년 3월 28일자로 등재되었습니다. 식물 분야에서 NGS 기술을 이용한 RNA-seq…
2014-05-19
Web database
유전체 정보 실용화를 지원하는 웹 데이터베이스 개발
NGS 기술의 개발은 유전체 분석의 가속화를 이끌어 현재 다수의 식물 유전체가 해독이 되었으며, 방대한 양의 신규 및 비교 유전체 정보, 이른바 빅데이터(Big data)가 생산되어, 이를 처리하기 위한 기술 개발이 요구되고 있습니다. 범세계적으로 표준유전체 해독과 같은 작물 유전체연구가 핵심집단, 육종 주요계통, 유전분석집단 등으로…
2014-05-19
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